Die Wüstenspringmaus ist nur nachts aktiv, wenn es kühler wird. Sie lebt einzelgängerisch und gräbt im Sand spiralförmige Baue, die gegen den Uhrzeigersinn verlaufen, bis zu etwa 1,2 m tief sind und zusätzliche Ausgänge haben; das Nest liegt an ihrem unteren Ende. Sie bewegt sich hüpfend auf ihren großen Hinterbeinen fort, und ein einzelner Sprung kann mehrere Meter weit sein.
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