Las fuentes discrepan sobre el origen de la sandía: la «Flora of Pakistan» la describe como nativa de la región del Kalahari, y la «Flora of China» del sur de África. Un estudio genómico publicado en 2022 presenta pruebas a favor de un antepasado del noreste de África, el «melón de Kordofán» de pulpa blanca y dulce, que cultivan los agricultores de Kordofán y Darfur, en Sudán. Según el estudio, las representaciones egipcias indican que la pulpa de sandía se consumía como postre hacia unos 4360 años antes del presente (BP, con referencia en 1950).
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