Le poisson-anémone à deux bandes se reproduit en couples monogames et pond des œufs ovales qui adhèrent au fond ; le mâle se charge de les garder et de les aérer. Il peut changer de sexe, de mâle à femelle, en 26 à 145 jours : lors d'une expérience sur le terrain, un mâle fonctionnel a pondu des œufs 26 jours après le retrait de la femelle.
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