Le fouette-queue d'Égypte compte trois sous-espèces : la sous-espèce nominale en Égypte et dans les régions voisines, la sous-espèce « microlepis » dans les déserts de la péninsule Arabique, et la sous-espèce « leptieni » à Oman et aux Émirats arabes unis, des environs de Mascate jusqu'à la péninsule de Musandam, en passant par la plaine de la Batinah et les piémonts des monts Hajar.
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